腹瀉的原發(fā)疾病或病因診斷主要須從病史、癥狀、體征、常規(guī)化驗(yàn)特別是糞便檢驗(yàn)中獲得依據(jù)。許多病例通過仔細(xì)分析病史和上述檢查的初步結(jié)果，往往可以得出正確診斷。

　　若診斷仍不清楚，可進(jìn)一步作X線唄灌腸和鋇餐檢查，和（或）直、結(jié)腸鏡檢查。如仍無明確結(jié)論，則須根據(jù)不同情況選用超聲、CT、內(nèi)鏡逆行膽胰管造影（ERCP）等影象診斷方法以檢查膽、胰疾病，或進(jìn)行小腸吸收功能試驗(yàn)、呼氣試驗(yàn)、小腸粘膜活檢以檢查小腸吸收不良。

　　高度懷疑腸結(jié)核、腸阿米巴病等有特效治療的疾病，經(jīng)過努力都不能確診時(shí)，可在一定限期內(nèi)進(jìn)行治療試驗(yàn)。

　　反復(fù)多次查大便常規(guī)，病原學(xué)檢查，各種細(xì)菌培養(yǎng)、查阿米巴原蟲及病毒等。